Окончив школу, Эмилия поступила в Лондонский драматический театр. Талан девушки сразу был замечен. Еще в студенчестве она сыграла значимые роли на сцене драматического театра. Одним из таких стал спектакль А.П. Чехова «Дикий мед», в котором она сыграла роль Анны Петровны. За свою игру актриса получила много положительных отзывов и признание критиков. Уже в скором времени Кларк была зачислена в труппу театра. Популярность актрисы настолько быстро возрастала, что от режиссеров наперебой поступали приглашения в различные спектакли. Играя на сцене Эмилия показала свою разноплановость, она без проблем могла передать характер своей героини. Среди ее успешных работ в театре можно назвать «Гамлет», «Сон в летнюю ночь», «Проснись и пой».